Gauliga Бавария 1939/40 был седьмой сезон Gauliga Bayern (официально: Бавария дивизии ) в футболе. Как и во всех дивизионах, раунд был первоначально приостановлен после первого игрового дня из-за начала Второй мировой войны . В то время как другие дивизионные классы в южной Германии были разделены на группы, и их чемпионаты не начинались до конца ноября, чемпионат Гауме в Баварии был возобновлен 29 октября 1939 года в первоначально запланированной лиге с участием десяти команд. 1. ФК «Нюрнберг» смог вернуть себе титул, с которым в этом году пришлось бороться с BC 1907 «Аугсбург» как с самым сложным соперником. В последующем финальном туре чемпионата Германии «клуб» провалился в предварительном раунде на SV Waldhof Mannheim. Поскольку дивизион 1940/41 начался в течение двух сезонов и был кратко увеличен до 13 команд, продвинутые VfR 07 Schweinfurt и FSV Nürnberg остались в верхней палате баварских команд . Würzburger Kickers и Schwaben Augsburg выросли из окружных классов .